После окончания Первой Тибериумной Войны и “смерти” Кейна, Братство распалось на более мелкие группы, которые длительное время боролись больше против самих себя, чем против ГДИ. Кроме того, один из самых влиятельных лидеров НОД был завербован сотрудниками ГДИ, которые таким образом контролировали деятельность Братства. Но командир Черной Руки Антон Славик, после того, как избежал смерти от рук Хасана, продолжил свою кампанию по обьединению Братства и устранению предателя.
После казни Хасана произошло еще одно большое событие – возвращение Кейна! Буквально сразу же началась Вторая Тибериумная Война. Войска НОД начали активное наступление на позиции ГДИ, и кроме всех прочих успехов, им удалось захватить большие военные базы Феникс и Хаммерфест. Кроме того был захвачен Таситус – матрица данных с большими знаниями о тибериуме, с помощью которой Кейн планировал запуск и последующую детонацию “Ракеты для изменения Мира”, которая должна была преобразовать планету Земля, введя ее в мир тибериума. Но с помощью армии мутантов – Забытых, ГДИ провела рад операций в результате снова одержав победу над НОД. В итоге, Кейн был убит в своем храме в Каире, офицером ГДИ Майклом Мак’Нилом.
